Miljøstyrelsen overvåger miljøtilstanden i fjorde og havområder via 8 miljøskibe. På baggrund af de indsamlede data vurderes, om områderne kan leve op til de målsætninger, der er vedtaget i Vandområdeplan 2015-2021.
I Vandområdeplan 2015-2021 er det generelt målsætningen, at kystvandene og fjordene skal have en vandkvalitet på minimum ”God økologisk tilstand”.
Der er i alt 9 målsatte kystvande og fjorde i Vordingborg Kommune.
Tabel der viser kystvandes vandkvalitetstilstand og målsætning
| Kystvande | Vandkvalitetstilstand | Målsætning |
| Avnø Fjord | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Dybsø Fjord | Dårlig økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Fakse Bugt | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Grønsund | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Hjelm Bugt | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Præstø Fjord | Ringe økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Smålandsfarvandet | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Stege Bugt | Moderat økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
| Stege Nor | Ringe økologisk tilstand | God økologisk tilstand |
I Vandområdeplan 2015-2021 blev Stege Bugt angivet med en god økologisk tilstand. Men i basisanalysen til Vandområdeplan 2021-2027 er vandkvalitetstilstanden i Stege Bugt faldet til moderat økologisk tilstand.
Tilsvarende er vandkvalitetstilstanden i Stege Nor målt til ringe økologisk tilstand i basisanalysen til Vandområdeplan 2021-2027.